-
التفسير الكبير أو مفاتيح الغيب.
-
التفسير الصغير، أسرار التنزيل وأنوار التأويل.
-
تأسيس التقديس (أساس التقديس في علم الكلام)، مجلد، ألفه للسلطان الملك العادل أبي بكر بن أيوب، فبعث له عنه ألف دينار.
-
المطالب العالية من العلم الإلهي، في ثلاثة مجلدات، ولم يتمه، وهو من آخر تصانيفه.
-
محصل أفكار المتقدمين والمتأخرين من العلماء والحكماء والمتكلمين.
-
اعتقادات فرق المسلمين والمشركين.
-
المحصول في علم أصول الفقه.
-
المباحث المشرقية في علم الإلهيات والطبيعيات.
-
لوامع البينات شرح أسماء الله تعالى والصفات.
-
معالم أصول الدين.
-
الأربعين في أصول الدين.
-
المسائل الخمسون في أصول الدين.
-
البيان والبرهان في الرد على أهل الزيغ والطغيان.
-
المباحث العمادية في المطالب المعادية.
-
إرشاد النظار إلى لطائف الأسرار.
-
نهاية الإيجاز في دراية الإعجاز.
-
نهاية العقول في دراية الأصول، مجلدان.
-
مناقب الإمام الشافعي.
-
ترجيح مذهب الشافعي وأخباره.
-
النفس والروح وشرح قواهما في علم الأخلاق.
-
الانارات في شرح الإشارات.
-
لباب الإشارات والتنبيهات (شرح الإشارات والتنبيهات لابن سينا).
-
شرح كتاب عيون الحكمة لابن سينا.
-
فضائل الصحابة.
-
القضاء والقدر.
-
ذم الدنيا.
-
نفثة المصدور.
-
الرياض المونقة.
-
تعجيز الفلاسفة، بالفارسية.
-
اللطائف الغياثية.
-
البراهين البهائية، بالفارسية.
-
الرسالة الكمالية في الحقائق الإلهية، بالفارسية لكمال الدين محمد بن ميكائيل، عربها تاج الدين الأرموي.
-
رسالة الجوهر الفرد.
-
شرح كتاب المفصل للزمخشري في النحو، لم يتمه.
-
شرح نهج البلاغة، لم يتمه.
-
شرح ديوان المتنبي.
-
المشيخة الفخرية.
-
الملل والنحل.
-
إبطال القياس.
-
الخلق والبعث.
-
سراج القلوب.
-
الجامع الكبير، لم يتم، ويعرف أَيْضًا بكتاب الطب الكبير.
-
التشريح من الرأس إلى الحلق، لم يتمه.
-
الآيات البينات، في المنطق.
-
الملخص، في الفلسفة.
-
الأخلاق.
-
الفراسة.
-
الأشربة.
-
الرعاية.
-
الزبدة.
-
كتاب في الهندسة.
-
كتاب في النبض، مجلد.
-
كتاب في الرمل.
-
مسائل في الطب.
-
رسالة في النفس.
-
رسالة في النبوات.
-
رسالة في التنبيه على بعض الأسرار المودعة في بعض سور القرآن العظيم.
-
قصة السحر والسحرة في القرآن الكريم.
-
خلق القرآن بين المعتزلة وأهل السنة.
-
الكاشف عن أصول الدلائل وفصول العلل.
-
عجائب القرآن.
-
المناظرات العقدية.
-
شفاء العي والخلاف أو شفاء العي من الخلاف.
-
عمدة الأنظار وزينة الأفكار.
-
الرسالة المحمدية.
-
الرسالة المجدية.
-
الرسالة الصاحبية.
-
مباحث الوجود.
-
مباحث الجدل.
-
مباحث الحدود.
-
الاختبارات السماوية.
-
الاختبارات العلائية.
-
الموسوم في السر المكتوم.
-
الطريقة العلائية في الخلاف، أربع مجلدات.
-
شرح مصادرات إقليدس.
-
شرح سقط الزند لأبي العلاء.
-
شرح الوجيز للغزالي، لم يتمه، حصل منه العبادات والنكاح في ثلاث مجلدات.
-
شرح كليات القانون، لم يتمه، وألفه للحكيم ثقة الدين عبد الرحمن بن عبد الكريم السرخسي.
-
حدائق الأنوار في حقائق الأسرار: فيه موضوعات ستين علماً، ألفه للسلطان علاء الدين تكش الخوارزمي.
-
درة التنزيل وغرة التأويل (في الآيات المتشابهات).
-
عصمة الأنبياء.
-
رسالة الحدوث.
-
الجمل في الكلام
-
تهذيب الدلائل وعيون المسائل.
-
المباحث المشرقية في العلم الإلهي.
-
المعالم، وهو آخر مصنفاته من الصغار.