قدم الدكتور محمد رجب البيومي واحد من أشهر مؤلفاته وهو كتاب من نبع القرآن الكريم، وقد تناول فيه الكثير من النقاط بأسلوب أدبي شيق وبسيط، مع مراعاة البعد عن المصطلحات المعقدة. 

كتاب مناهل العرفان في علوم القرآن قدمه المؤلف مستمدًا معارفه من كتب علماء الإسلام قديمًا وحديثًا في القرآن الكريم وعلومه والتفسير ومقدماته وعلم تاريخ التشريع وعلمي الكلام والأصول وعلوم اللغة العربية ومعاجمها وعلمي الفلسفة والاجتماع وعلمي النفس والأخلاق وبعض البحوث المنثورة هنا وهناك في غضون الرسائل والمجلات.